公海jcjc5500与设备管理处是负责学校公海jcjc5500与贵重实验仪器设备管理的行政职能部门，于2019年4月在原公海jcjc5500与设备管理办公室基础上更名成立，现设有公海jcjc5500建设管理科、公海jcjc5500安全管理科、翔安校区实验办和分析测试中心，在职工作人员15人。